尽管化石记录最早为传统学说提供了支持,但巴拿马地峡两岸的海洋蕴涵着更令人信服的证据。1982年,美国伍兹霍尔海洋研究所的Lloyd Keigwin发现巴拿马地峡两岸的氧同位素于400万年前开始出现分叉,这暗示着加勒比海的盐度在那时开始上升,这有可能是巴拿马地峡变浅的结果。综合考虑碳13的变化之后,氧同位素的数据暗示,现代加勒比海与东太平洋的大洋环流模式始于300万年前。
在接下来的25年里,一系列关于古海洋学的研究有力地印证了标准模型。例如研究者发现在460万年前,加勒比海底的碳酸盐开始堆积,反映出深海环流的缓慢变化。然后在大约350万年前,喜碳酸盐环境的有孔虫类和珊瑚出现在化石记录中。分子遗传学数据也显示,物种的多样化进程在这一时期开始加速。
巴拿马地峡关闭的另一个影响便是:加勒比海的上升流开始衰竭(来自寒冷深海的海水向上流动,并将营养物质带到浅海)。受上升流衰竭影响,海底生物开始灭绝。而在该海域栖息的物种种类也从发育快速的物种转变为生长缓慢的物种。
Jackson认为,直到大约400万年前,加勒比深海的环境与东太平洋深海的环境如出一辙。他说:“海域的核心数据使新假说不攻自破。从地球化学角度讲,如果有一块大陆横亘在中间,加勒比海与太平洋的深海数据又怎么可能毫无出入。”
S型特征
Jaramillo与Montes设立新假说的研究始于一项获资100万美元的旨在拓宽运河航道的研究。Jaramillo运用地质学研究方法调查了巴拿马运河河岸的岩石,并附带研究了如何保护当地的数千种物种。
他们利用放射性同位素、地球化学以及古地磁学的研究方法来确定岩石的年代,鉴别岩层间的关系。Montes说:“起初,我们对传统学说所说的巴拿马地峡形成于300万年前这一理论深信不疑。”